Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0A6

Hbq1b, Globin d1, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbq1bQ3U0A6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Hbq1bQ3U0A6 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Hbq1bQ3U0A6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Hbq1bQ3U0A6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Hbq1bQ3U0A6 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Hbq1bQ3U0A6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Hbq1bQ3U0A6 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Hbq1bQ3U0A6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hbq1bQ3U0A6 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hbq1bQ3U0A6 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hbq1bQ3U0A6 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hbq1bQ3U0A6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Hbq1bQ3U0A6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Hbq1bQ3U0A6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
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Hbq1bQ3U0A6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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Hbq1bQ3U0A6 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hbq1bQ3U0A6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hbq1bQ3U0A6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hbq1bQ3U0A6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Hbq1bQ3U0A6 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Hbq1bQ3U0A6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hbq1bQ3U0A6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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Hbq1bQ3U0A6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hbq1bQ3U0A6 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms