Protein–RNA interactions for Protein: Q3TRM8

Hk3, Hexokinase-3, mousemouse

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Length 922 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hk3Q3TRM8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Hk3Q3TRM8 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Hk3Q3TRM8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Hk3Q3TRM8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms