Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Fam172aQ3TNH5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fam172aQ3TNH5 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fam172aQ3TNH5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms