Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR3

Nlrp4c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4cQ3TKR3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nlrp4cQ3TKR3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nlrp4cQ3TKR3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nlrp4cQ3TKR3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms