Protein–RNA interactions for Protein: Q3LR78

Zbtb38, CtBP-interacting BTB zinc finger protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb38Q3LR78 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb38Q3LR78 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb38Q3LR78 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Zbtb38Q3LR78 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Zbtb38Q3LR78 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Zbtb38Q3LR78 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Zbtb38Q3LR78 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms