Protein–RNA interactions for Protein: Q2KN98

Specc1l, Cytospin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1lQ2KN98 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Specc1lQ2KN98 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Specc1lQ2KN98 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Specc1lQ2KN98 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Specc1lQ2KN98 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms