Protein–RNA interactions for Protein: Q1EG27

Myo3b, Myosin-IIIb, mousemouse

Predictions only

Length 1,305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo3bQ1EG27 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Myo3bQ1EG27 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Myo3bQ1EG27 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Myo3bQ1EG27 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Myo3bQ1EG27 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms