Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Perm1Q149B8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Perm1Q149B8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Perm1Q149B8 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Perm1Q149B8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Perm1Q149B8 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Perm1Q149B8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Perm1Q149B8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms