Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Sox4Q06831 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Sox4Q06831 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sox4Q06831 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms