Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Apoc2Q05020 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Apoc2Q05020 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Apoc2Q05020 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms