Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Sox9Q04887 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Sox9Q04887 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sox9Q04887 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms