Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
NfiaQ02780 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NfiaQ02780 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
NfiaQ02780 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NfiaQ02780 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms