Protein–RNA interactions for Protein: Q02242

Pdcd1, Programmed cell death protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd1Q02242 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pdcd1Q02242 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pdcd1Q02242 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Pdcd1Q02242 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms