Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Cacna1cQ01815 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Cacna1cQ01815 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Cacna1cQ01815 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms