Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Itga4Q00651 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Itga4Q00651 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Itga4Q00651 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 249.3 ms