Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HmmrQ00547 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HmmrQ00547 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HmmrQ00547 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HmmrQ00547 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms