Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Taf1bP97358 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Taf1bP97358 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Taf1bP97358 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Taf1bP97358 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms