Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Irx1P81068 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx1P81068 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Irx1P81068 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx1P81068 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Irx1P81068 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Irx1P81068 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Irx1P81068 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms