Protein–RNA interactions for Protein: P79568

H2-Q6, Class Ib MHC antigen Qa-2, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q6P79568 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q6P79568 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q6P79568 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q6P79568 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
H2-Q6P79568 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
H2-Q6P79568 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
H2-Q6P79568 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1114.6 ms