Protein–RNA interactions for Protein: P70368

Sebox, Homeobox protein SEBOX, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SeboxP70368 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SeboxP70368 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SeboxP70368 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeboxP70368 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SeboxP70368 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SeboxP70368 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SeboxP70368 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeboxP70368 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeboxP70368 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeboxP70368 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SeboxP70368 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms