Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Plxna3P70208 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Plxna3P70208 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Plxna3P70208 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Plxna3P70208 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms