Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba52P62984 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Uba52P62984 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba52P62984 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Uba52P62984 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Uba52P62984 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba52P62984 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba52P62984 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba52P62984 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba52P62984 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Uba52P62984 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms