Protein–RNA interactions for Protein: P62908

Rps3, 40S ribosomal protein S3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps3P62908 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rps3P62908 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3P62908 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3P62908 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3P62908 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3P62908 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3P62908 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3P62908 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rps3P62908 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps3P62908 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps3P62908 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Rps3P62908 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Rps3P62908 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps3P62908 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps3P62908 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps3P62908 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rps3P62908 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms