Protein–RNA interactions for Protein: P62823

Rab3c, Ras-related protein Rab-3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3cP62823 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab3cP62823 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab3cP62823 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab3cP62823 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.3 ms