Protein–RNA interactions for Protein: P59672

Anks1a, Ankyrin repeat and SAM domain-containing protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Anks1aP59672 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Anks1aP59672 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Anks1aP59672 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Anks1aP59672 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Anks1aP59672 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Anks1aP59672 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Anks1aP59672 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms