Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P58686 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P58686 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P58686 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P58686 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P58686 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P58686 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P58686 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P58686 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P58686 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P58686 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P58686 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P58686 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P58686 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P58686 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P58686 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P58686 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P58686 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P58686 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P58686 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
P58686 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
P58686 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P58686 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P58686 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P58686 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
P58686 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
P58686 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P58686 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
P58686 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P58686 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P58686 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P58686 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
P58686 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P58686 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P58686 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P58686 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
P58686 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P58686 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P58686 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
P58686 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
P58686 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P58686 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P58686 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P58686 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
P58686 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P58686 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P58686 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
P58686 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
P58686 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P58686 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P58686 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P58686 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P58686 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P58686 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P58686 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P58686 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P58686 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P58686 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P58686 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P58686 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P58686 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P58686 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P58686 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P58686 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P58686 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P58686 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P58686 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P58686 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P58686 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P58686 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
P58686 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P58686 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P58686 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P58686 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P58686 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P58686 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P58686 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
P58686 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P58686 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P58686 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P58686 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms