Protein–RNA interactions for Protein: P58467

Setd4, SET domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd4P58467 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Setd4P58467 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd4P58467 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd4P58467 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Setd4P58467 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Setd4P58467 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd4P58467 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd4P58467 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd4P58467 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Setd4P58467 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.8 ms