Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Uchl4P58321 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uchl4P58321 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uchl4P58321 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms