Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gp1bbP56400 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gp1bbP56400 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gp1bbP56400 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gp1bbP56400 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms