Protein–RNA interactions for Protein: P56386

Defb1, Beta-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 69 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb1P56386 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Defb1P56386 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defb1P56386 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Defb1P56386 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
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