Protein–RNA interactions for Protein: P54731

Faf1, FAS-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Faf1P54731 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Faf1P54731 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Faf1P54731 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Faf1P54731 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Faf1P54731 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Faf1P54731 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms