Protein–RNA interactions for Protein: P52483

Ube2e3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3P52483 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ube2e3P52483 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Ube2e3P52483 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Ube2e3P52483 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms