Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc1a1P51906 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc1a1P51906 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc1a1P51906 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms