Protein–RNA interactions for Protein: P43488

Tnfsf4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf4P43488 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Tnfsf4P43488 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Tnfsf4P43488 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tnfsf4P43488 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms