Protein–RNA interactions for Protein: P42337

Pik3ca, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pik3caP42337 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pik3caP42337 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pik3caP42337 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pik3caP42337 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pik3caP42337 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms