Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Ptpn1P35821 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ptpn1P35821 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ptpn1P35821 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms