Protein–RNA interactions for Protein: P33146

Cdh15, Cadherin-15, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh15P33146 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cdh15P33146 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Cdh15P33146 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cdh15P33146 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms