Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gsx2P31316 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gsx2P31316 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gsx2P31316 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms