Protein–RNA interactions for Protein: P31257

Hoxc10, Homeobox protein Hox-C10, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc10P31257 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxc10P31257 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Hoxc10P31257 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Hoxc10P31257 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxc10P31257 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.4 ms