Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprmP28828 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
PtprmP28828 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprmP28828 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprmP28828 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprmP28828 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PtprmP28828 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprmP28828 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
PtprmP28828 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprmP28828 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PtprmP28828 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprmP28828 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC31.18■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PtprmP28828 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms