Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
RxraP28700 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxraP28700 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxraP28700 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxraP28700 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxraP28700 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
RxraP28700 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
RxraP28700 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxraP28700 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxraP28700 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxraP28700 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxraP28700 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxraP28700 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
RxraP28700 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxraP28700 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
RxraP28700 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxraP28700 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxraP28700 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxraP28700 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxraP28700 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
RxraP28700 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxraP28700 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxraP28700 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxraP28700 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
RxraP28700 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxraP28700 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxraP28700 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxraP28700 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
RxraP28700 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxraP28700 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxraP28700 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxraP28700 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
RxraP28700 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxraP28700 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxraP28700 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
RxraP28700 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
RxraP28700 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
RxraP28700 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxraP28700 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxraP28700 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxraP28700 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxraP28700 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxraP28700 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
RxraP28700 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxraP28700 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxraP28700 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxraP28700 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxraP28700 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxraP28700 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
RxraP28700 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RxraP28700 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
RxraP28700 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxraP28700 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxraP28700 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxraP28700 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
RxraP28700 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxraP28700 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxraP28700 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
RxraP28700 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxraP28700 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxraP28700 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxraP28700 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxraP28700 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxraP28700 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxraP28700 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RxraP28700 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxraP28700 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxraP28700 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxraP28700 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxraP28700 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxraP28700 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RxraP28700 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RxraP28700 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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