Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gjb3P28231 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gjb3P28231 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gjb3P28231 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gjb3P28231 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.9 ms