Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pde6aP27664 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pde6aP27664 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pde6aP27664 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pde6aP27664 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms