Protein–RNA interactions for Protein: P26049

Gabra3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra3P26049 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Gabra3P26049 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gabra3P26049 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gabra3P26049 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms