Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Myo5bP21271 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Myo5bP21271 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Myo5bP21271 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Myo5bP21271 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5bP21271 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5bP21271 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5bP21271 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5bP21271 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Myo5bP21271 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms