Protein–RNA interactions for Protein: P20152

Vim, Vimentin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VimP20152 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VimP20152 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
VimP20152 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
VimP20152 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
VimP20152 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VimP20152 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VimP20152 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
VimP20152 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
VimP20152 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VimP20152 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VimP20152 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
VimP20152 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VimP20152 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VimP20152 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VimP20152 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
VimP20152 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
VimP20152 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
VimP20152 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
VimP20152 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VimP20152 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VimP20152 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
VimP20152 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
VimP20152 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VimP20152 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VimP20152 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
VimP20152 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
VimP20152 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VimP20152 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VimP20152 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
VimP20152 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
VimP20152 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VimP20152 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
VimP20152 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VimP20152 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VimP20152 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
VimP20152 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VimP20152 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
VimP20152 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
VimP20152 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VimP20152 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VimP20152 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VimP20152 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VimP20152 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
VimP20152 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
VimP20152 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VimP20152 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VimP20152 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
VimP20152 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VimP20152 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VimP20152 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VimP20152 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
VimP20152 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
VimP20152 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VimP20152 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VimP20152 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VimP20152 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VimP20152 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VimP20152 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
VimP20152 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
VimP20152 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VimP20152 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
VimP20152 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
VimP20152 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms