Protein–RNA interactions for Protein: P16388

Kcna1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna1P16388 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcna1P16388 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Kcna1P16388 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Kcna1P16388 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms