Protein–RNA interactions for Protein: P16125

Ldhb, L-lactate dehydrogenase B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LdhbP16125 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdhbP16125 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
LdhbP16125 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdhbP16125 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LdhbP16125 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LdhbP16125 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdhbP16125 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
LdhbP16125 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LdhbP16125 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LdhbP16125 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LdhbP16125 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms