Protein–RNA interactions for Protein: P15499

Prph2, Peripherin-2, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prph2P15499 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Prph2P15499 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Prph2P15499 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Prph2P15499 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prph2P15499 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Prph2P15499 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Prph2P15499 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms