Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Nr4a1P12813 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Nr4a1P12813 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Nr4a1P12813 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms